alignment to pre-microRNA

Back
GGCACCCACCCGTAGAACCGACCTTGCGGGGCCTTCGCCGCACACAAGCTCGTGTCTGTGGGTCCGTGTC  22(5.8/27.9) adj:22
(((((..(((((((((..(((.((((.(.(((....))).)...)))).)))..)))))))))..)))))
CACCCGTAGAACCGACCTTGC 9(2.4/11.4) adj:9 + lv3p|lv3pT|lv3p#-1
CACCCGTAGAACCGACCTTGCG 8(2.1/10.2) adj:8 + exact
CACCCGTAGAACCGACCTTGCGA 5(1.3/6.3) adj:5 + nta#A|nta#A#1