alignment to pre-microRNA

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CCCATGTTCATTGAGCTTTATTCACAGTGGCTAAGCTATGGAATCCATCCAAGTGTTCACTGATGGATAAATGGATACAGAAAATGTTTATATATATATATATAATATT  118(31/149.7) adj:39.7
.((((((((...)))).(((((((((((((....(((.((((.....)))))))..)))))).)))))))))))........((((((.(((((....)))))))))))
TTCACAGTGGCTAAG 116(30.5/147.2) adj:38.7 + lv3p|lv3pT|lv3p#-6$lv3p|lv3pT|lv3p#-4
TTCACAGTGGCTAAGTTATG 2(0.5/2.5) adj:1 + lv3p|lv3pT|lv3p#-1$lv3p|lv3pE|lv3p#1