alignment to pre-microRNA

Back
TCCAGCCTGTGCCCAGCAGCCCCTGAGAACCACGTCTGCTCTGAGCTGGGTACTGCCTGTTCAGAACAAATGCCGGTTCCCAGACGCTGCCAGCTGGCC  62(16.3/78.7) adj:62
.(((((.((......(((((..(((.(((((.(((.((.(((((((.((......)).))))))).)).)))..))))).)))..))))))))))))..
TGAGAACCACGTCTGCTCTGA 48(12.6/60.9) adj:48 + lv3p|lv3pT|lv3p#-1
TGAGAACCACGTCTGCTCTG 5(1.3/6.3) adj:5 + lv3p|lv3pT|lv3p#-2
TCAGAACAAATGCCGGTTCCCAGA 5(1.3/6.3) adj:5 + exact
TGAGAACCACGTCTGCTCTGT 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#T|nta#T#1
TCAGAACAAATGCCGGTTCCCAGT 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#T|nta#T#1