alignment to pre-microRNA

Back
ATGGTGTTATCAAGTGTAACAGCAACTCCATGTGGACTGTGTACCAATTTCCAGTGGAGATGCTGTTACTTTTGATGGTTACCAA  587(154.4/744.8) adj:295
.(((((.(((((((.(((((((((.((((((.((((..((......)).)))))))))).))))))))).)))))))..))))).
TGTAACAGCAACTCCATGTGGA 500(131.5/634.4) adj:250 + exact
TGTAACAGCAACTCCATGTGG 42(11/53.3) adj:21 + lv3p|lv3pT|lv3p#-1
TGTAACAGCAACTCCATGTGGG 15(3.9/19) adj:7.5 + nta#G|nta#G#1
TGTAACAGCAACTCCATGTGGAT 12(3.2/15.2) adj:6 + nta#T|nta#T#1
TGTAACAGCAACTCCATG 10(2.6/12.7) adj:5 + lv3p|lv3pT|lv3p#-4
TGTAACAGCAACTCCATGTGGAC 3(0.8/3.8) adj:3 + lv3p|lv3pE|lv3p#1
TGTAAAAGCAACTCCATGTGGA 3(0.8/3.8) adj:1.5 + exactNucVar|5:C>A
TGTAACAGCAACTCCATGTGGT 2(0.5/2.5) adj:1 + nta#T|nta#T#1