alignment to pre-microRNA

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TTGAGGCCTTAAAGTACTGTAGCAGCACATCATGGTTTACATGCTACAGTCAAGATGCGAATCATTATTTGCTGCTCTAGAAATTTAAGGAAATTCAT  244(64.2/309.6) adj:237.3
.((((.(((((((...(((.(((((((.((.(((((((.(((.((.......))))).))))))).)).))))))).)))...)))))))...)))).
TAGCAGCACATCATGGTTTACA 119(31.3/151) adj:119 + exact
CGAATCATTATTTGCTGCTCT 41(10.8/52) adj:41 + lv3p|lv3pT|lv3p#-1
CGAATCATTATTTGCTGCT 22(5.8/27.9) adj:22 + lv3p|lv3pT|lv3p#-3
TAGCAGCACATCATGGTTTAC 17(4.5/21.6) adj:17 + lv3p|lv3pT|lv3p#-1
TGCTACAGTCAAGATG 10(2.6/12.7) adj:3.3 + .
CGAATCATTATTTGCTGCTC 10(2.6/12.7) adj:10 + lv3p|lv3pT|lv3p#-2
CGAATCATTATTTGCTGCTCTA 8(2.1/10.2) adj:8 + exact
TAGCAGCACATCATGGTTTA 7(1.8/8.9) adj:7 + lv3p|lv3pT|lv3p#-2
TAGCAGCACATCATGGTT 4(1.1/5.1) adj:4 + lv3p|lv3pT|lv3p#-4
TAGCAGCACATCATGGTTT 3(0.8/3.8) adj:3 + lv3p|lv3pT|lv3p#-3
CGAATCATTATTTGCTGCTCTAA 3(0.8/3.8) adj:3 + nta#A|nta#A#1