alignment to pre-microRNA

Back
TTTCCTGCCCTCGAGGAGCTCACAGTCTAGTATGTCTCATCCCCTACTAGACTGAAGCTCCTTGAGGACAGGGATGGTCATACTCACCTC  453(119.1/574.8) adj:448.5
.((((((.((((((((((((..((((((((((.(........).)))))))))).)))))))))))).)))))).(((.......)))..
TCGAGGAGCTCACAGTCTAGT 109(28.7/138.3) adj:109 + exact
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGG 82(21.6/104) adj:82 + exact
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGGA 72(18.9/91.4) adj:72 + lv3p|lv3pE|lv3p#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGGT 42(11/53.3) adj:42 + nta#T|nta#T#1
TCGAGGAGCTCACAGTCTAGTA 34(8.9/43.1) adj:34 + lv3p|lv3pE|lv3p#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGA 20(5.3/25.4) adj:20 + nta#A|nta#A#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGT 17(4.5/21.6) adj:17 + nta#T|nta#T#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGGAT 14(3.7/17.8) adj:14 + nta#T|nta#T#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAG 14(3.7/17.8) adj:14 + lv3p|lv3pT|lv3p#-1
TCGAGGAGCTCACAGTCTAG 7(1.8/8.9) adj:3.5 + lv3p|lv3pT|lv3p#-1$lv3p|lv3pE|lv3p#2
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGGAA 6(1.6/7.6) adj:6 + nta#A|nta#A#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGAA 6(1.6/7.6) adj:6 + nta#A|nta#A#2
TCGAGGAGCTCACAGTCTAGTT 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#T|nta#T#1
TCGAGGAGCTCACAGTCT 2(0.5/2.5) adj:1 + lv3p|lv3pT|lv3p#-3$exact
TACTAGACTGAAGCTCCTTGAGGA 2(0.5/2.5) adj:2 + mv
ACTAGACTGAAGCTCCTTGAGG 2(0.5/2.5) adj:2 + lv5p|lv5pE|lv5p#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGGTTT 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#T|nta#T#3
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGGATT 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#T|nta#T#2
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGGAAT 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#T|nta#T#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGGTT 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#T|nta#T#2
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGGTA 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#A|nta#A#1
CTAGACTCAAGCTCCTTGAGGA 2(0.5/2.5) adj:2 + lv3p|lv3pE|lv3p#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAGAT 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#T|nta#T#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGAA 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#A|nta#A#1
CTAGACTGAAGCTCCTTGA 2(0.5/2.5) adj:2 + lv3p|lv3pT|lv3p#-2
CTAGACTGAAGCTCCT 2(0.5/2.5) adj:2 + lv3p|lv3pT|lv3p#-5
TAGACTGAAGCTCCTTGAGGAT 2(0.5/2.5) adj:2 + nta#T|nta#T#1