alignment to pre-microRNA

Back
AAACACTTGAGCCCAGCGGTTTGAGGCTACAGTGAGATGTGATCCTGCCACATCTCACTGTAGCCTCGAACCCCTGGGCTCAAGTGATTCA  42(11/53.3) adj:42
...(((((((((((((.((((((((((((((((((((((((.......)))))))))))))))))))))))).))))))))))))).....
TCTCACTGTAGCATCGAACC 21(5.5/26.6) adj:21 + lv3p|lv3pT|lv3p#-2
TCTCACTGTAGCATCGAACCCC 8(2.1/10.2) adj:8 + exactNucVar|12:C>A
TCTCACTGTAGCATCGAACCC 8(2.1/10.2) adj:8 + lv3p|lv3pT|lv3p#-1
TCTCACTGTAGCATCGAACCCT 3(0.8/3.8) adj:3 + nta#T|nta#T#1
TCTCACTGTAGCATCGAACCCCT 2(0.5/2.5) adj:2 + lv3p|lv3pE|lv3p#1