alignment to pre-microRNA

Back
ACCAGACTTTTCCTAGTCCCTGAGACCCTAACTTGTGAGGTATTTTAGTAACATCACAAGTCAGGCTCTTGGGACCTAGGCGGAGGGGA  31(8.2/39.3) adj:22.5
.((...((((.(((((((((.((((.(((.((((((((.((.........)).)))))))).))).)))))))).))))).)))).)).
TCCCTGAGACCCTAACTTGTGAA 10(2.6/12.7) adj:5 + nta#A|nta#A#1
ACAAGTCAGGCTCTTGGGAC 8(2.1/10.2) adj:8 + lv5p|lv5pT|lv5p#-2
TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA 7(1.8/8.9) adj:3.5 + exact
ACAAGTCAGGCTCTTGGGACC 4(1.1/5.1) adj:4 + mv
ACAAGTCAGGCTCTTGGGACCT 2(0.5/2.5) adj:2 + mv